El principal argumento en contra es que los de bilingüe aprenden menos contenidos de la materia porque pierden tiempo con el inglés o lo simplifican para que sea más fácil. Eso no debería ser así y dependerá del profesor. De hecho, en Secundaria hay muchos profesores que dan la misma asignatura del mismo nivel a grupos en español y en inglés, y hacen lo mismo.
También depende mucho del alumno. Lógicamente si es un buen alumno pero tiene dificultades concretas con el inglés le puede perjudicar más que ayudar.